가면라이더 지오 다운로드

Entrez GEO 프로필 검색 페이지 상단의 `프로필 데이터 다운로드` 버튼을 사용하여 쿼리에 있는 유전자의 발현 값을 다운로드합니다. 위에서 설명한 Accession 디스플레이 막대를 사용하는 대안은 데이터를 검색하는 URL을 생성하는 것입니다. URL은 다음 예제와 같이 서식이 지정됩니다: 매개 변수 -b를 확인하고, 좋아하고, 다운로드를 백그라운드로 전송하고 로그를 생성합니다. 여러 다운로드에 적합합니다. 유닉스 플레이트폼에서 CRON으로 모든 작업을 자동화할 수 있습니다. GEO의 모든 데이터는 다양한 메커니즘을 사용하여 다양한 형식으로 다운로드할 수 있습니다. 다음 정보는 다운로드 옵션 및 형식을 나열합니다. FTP 사이트의 대부분의 파일은 gzip (.gz 또는 .tgz 확장자)을 사용하여 압축됩니다. 압축을 풀고 이러한 파일을 읽으려면 WinZip 또는 7-Zip과 같은 유틸리티를 사용하십시오. 또는 UNIX가 있는 경우 타르 및 건지프 명령을 사용하여 파일을 추출합니다(예: NCBI의 FTP 서버에 액세스하고 대량 FTP 전송을 최적화하는 것에 대한 보다 일반적인 정보)이 여기에 제공됩니다. .

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE1nnn/GSE1000/matrix/ . 나는 자동으로 다음 링크에서 타르 파일을 다운로드하고 싶습니다, 사람이 그렇게하는 방법을 알고 있습니까? 도구 아스페라를 확인하십시오. GEO는 이를 지원합니다. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47527/ 신경 쓰지 말고, 그냥 알아냈다. 나는 FTP 사이트에 가서 wget을 할 수 있습니다 : 당신은 다운로드의 매우 큰 숫자 또는 볼륨을 수행 하려는 경우, 당신은 아스페라 연결을 사용하여 높은 처리량 파일 전송을 고려할 수 있습니다 – 자세한 내용은 geo@ncbi.nlm.nih.gov 문의하시기 바랍니다. 모든 GEO 레코드 및 원시 데이터 파일은 FTP 사이트에서 대량 다운로드할 수 있습니다. 디렉터리 구조 및 파일 형식에 대한 자세한 내용은 README를 참조하십시오. 그러나 GEO는 이제 시간 시간 오류로 인해 웹 브라우저를 사용하여 일부 상위 디렉터리에 더 이상 액세스할 수 없는 많은 수의 제출을 보유하고 있습니다.

이러한 경우 상위 디렉터리를 우회하고 대상 디렉터리(예: 시리즈 GSE1000)로 직접 이동해야 합니다. . 이 URL은 액세스 GPL96의 `간략한` 보기를 포함하는 텍스트 파일을 검색합니다. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=gpl96&targ=self&view=brief&form=text . 모든 원본 레코드는 Entrez GEO 데이터 세트 인터페이스를 사용하여 검색하고 검색할 수 있습니다. 페이지 상단의 도구 모음을 `보내기: 파일`로 설정하여 결과를 내보낼 수 있습니다. GEO는 데이터를 다운로드하는 자동 도구를 제공해야 한다, 이러한 fastq-dump 링크 다양한 형식으로 가족 다운로드를 실험 하 고 보충 파일 각 GEO 시리즈 레코드의 기슭에 제공 됩니다. 이러한 파일은 gzip (.gz 또는 .tgz 확장자)을 사용하여 압축됩니다. 압축을 풀고 이러한 파일을 읽으려면 WinZip 또는 7-Zip과 같은 유틸리티를 사용하십시오. GEOquery 생체 전도체 패키지는 추가 처리/분석을 위해 R을 대상으로 하는 경우 생계를 위해 이 작업을 수행한다는 점에 유의하십시오.